Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

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Q

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U

V

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X

Y

Z

_

~

- r -

• r : eonc::geometry::atom, TinyMatrix< Type >
• r_cut : EAM::element_parameters
• R_init : eonc::AtomicGPDimer
• radius : EMT
• RAList : eonc::BondBoost
• random_rotation : eonc::metatomic_options_t, EonMtaConfig, RgpotMtaConfig
• random_rotation_ : MetatomicPotential
• random_seed : eonc::JobResultEnvelope
• randomMove() : eonc::GlobalOptimizationJob
• randomSeed : eonc::main_options_t
• randomSwap() : eonc::BasinHoppingJob
• ranks_per_image : eonc::rgpot_options_t, RGPotEngineOptions
• rate : eonc::prefactor_options_t, eonc::tunneling::RateInstanton
• ratio_at_limit : eonc::gpr_dimer_options_t
• raw() : eonc::VesinNeighbors
• raw_json : eonc::io::ConFrameMetadata
• rc_ : EAM, forcefields::SpceCcl::Water, forcefields::Tip4p::Water
• rCut2 : NeighborList
• re_ : forcefields::Ccl
• reactant : eonc::BasinHoppingSaddleSearch, eonc::DynamicsSaddleSearch, eonc::ParallelReplicaJob, eonc::piqtst::Rate, eonc::ReplicaDynamicsJob
• reactant_filename : eonc::instanton_options_t, eonc::oh_tst_options_t
• reactant_md_steps : eonc::oh_tst_options_t
• reactantEnergy : eonc::BGSDObjectiveFunction, eonc::BiasedGradientSquaredDescent, eonc::MinModeSaddleSearch, eonc::NudgedElasticBand
• reactantQRatio() : eonc::OHTSTJob
• readFU() : VASP
• realunits : LAMMPSPot
• recieveFromSystem() : AMS, AMS_IO, ExtPot
• recomputeFreeMask : eonc::Matter
• recomputeMaskedForces : eonc::Matter
• recomputePotential : eonc::Matter
• record : eonc::ReplicaDynamicsJob::PrdClock
• record_interval : eonc::parallel_replica_options_t, eonc::saddle_search_options_t::dynamics_t
• record_interval_input : eonc::parallel_replica_options_t, eonc::saddle_search_options_t::dynamics_t
• record_load() : eonc::Parameters
• recorded_ : eonc::pathintegral::RingPolymer
• recv_exact() : SocketNWChemPot
• recv_header() : SocketNWChemPot
• reference : eonc::piqtst::Coordinate
• referenceEnergy : eonc::tunneling::Splitting
• referencePositions : NeighborList
• refine : eonc::optimizer_options_t, eonc::ReplicaDynamicsJob
• refine_transition : eonc::parallel_replica_options_t
• refineFCalls : eonc::ReplicaDynamicsJob
• refineTransition() : eonc::DynamicsSaddleSearch, eonc::ParallelReplicaJob
• registerGPRObject() : GPRPotential
• registry_ : eonc::Potential
• relax() : eonc::Matter
• relax_conv_angle : eonc::gpr_dimer_options_t
• relax_rotations_max : eonc::gpr_dimer_options_t
• release() : eonc::VesinNeighbors
• releasePotential() : eonc::Job
• releaseWorkersAtExit() : RgpotPot
• remove_rotation : eonc::dimer_options_t, eonc::saddle_search_options_t
• remove_translation : eonc::StructureComparisonOptions
• removeNetForce : eonc::main_options_t, eonc::Matter
• removeStaleFiles() : VASP
• removeZeroFreqs() : eonc::Hessian
• ReNormalizePosition() : Atoms
• replica_exchange_options() : eonc::Parameters, eonc::ParametersLoadAccess
• replica_exchange_options_ : eonc::Parameters::Impl
• replica_exchange_options_t : eonc::Parameters
• replicas : eonc::replica_exchange_options_t, eonc::serve_options_t
• report() : eonc::GlobalOptimizationJob
• report_level : eonc::gpr_dimer_options_t::debug_params_t
• reportResults() : eonc::ReplicaDynamicsJob, eonc::SafeHyperJob, eonc::TADJob
• reqFd : LAMMPSPot
• require_loaded() : eonc::ARTnResource, eonc::IARTnResource, eonc::IIRAResource, eonc::ILammpsLoader, eonc::IMetatomicLoader, eonc::IRAResource, eonc::LammpsLoader, eonc::MetatomicLoader
• requiresIsolatedMoleculeLayout() : ASENwchemPot, ASEOrcaPot, eonc::Potential, RgpotAdapter< RPot >, RgpotPot, SocketNWChemPot
• res : XTBPot
• rescaleVelocity() : eonc::Dynamics
• reset() : eonc::LBFGS, eonc::PotRegistry
• resetAverages() : eonc::pathintegral::RingPolymer
• resetForceCalls() : eonc::Matter
• resetStability() : eonc::neb::OCINEBController
• resFd : LAMMPSPot
• resize() : eonc::Matter
• resources : AMS, eonc::ams_options_t
• restartFrom : AMS
• restore_fpe() : eonc::FPEHandler
• restore_unhelpful : eonc::neb::OCINEBController::Config, eonc::neb_options_t::climbing_image_options_t::hybrid_dimer_t
• restoreFileForces() : eonc::Matter
• restrainAngle() : forcefields::PotentialBase
• restrainLength() : forcefields::PotentialBase
• resume : eonc::hessian_options_t
• retain_climb_frames_ : eonc::MinModeSaddleSearch
• retainExchangeDir : ExtPot
• return_distances : eonc::VesinNeighbors::Options
• return_shifts : eonc::VesinNeighbors::Options
• return_vectors : eonc::VesinNeighbors::Options
• returnFiles : eonc::BasinHoppingJob, eonc::GPSurrogateJob, eonc::NudgedElasticBandJob, eonc::ParallelReplicaJob, eonc::ProcessSearchJob, eonc::ReplicaDynamicsJob, eonc::ReplicaExchangeJob, eonc::SaddleSearchJob
• rFermi : EMT
• rgpot_options() : eonc::Parameters, eonc::ParametersLoadAccess
• rgpot_options_ : eonc::Parameters::Impl
• rgpot_options_t : eonc::Parameters
• RgpotAdapter() : RgpotAdapter< RPot >
• RGPotEngine() : RGPotEngine
• RgpotPot() : RgpotPot
• rh1_ : forcefields::SpceCcl::Water, forcefields::Tip4p::Water
• rh2_ : forcefields::SpceCcl::Water, forcefields::Tip4p::Water
• rhh_ : forcefields::SpceCcl
• rho : eonc::ImprovedDimer
• rigidReference : eonc::tunneling::RateInstantonOptions
• rigidRotations : eonc::tunneling::RateInstantonOptions
• rigidSqrtMasses : eonc::tunneling::RateInstantonOptions
• ring : eonc::piqtst::RecrossingOptions, eonc::piqtst::ScanOptions
• RingPolymer() : eonc::pathintegral::RingPolymer
• ringPotential : eonc::tunneling::RateInstanton
• Rm : EAM::element_parameters
• rMax : CellList, NeighborList
• rMax2 : CellList
• rmd_time : eonc::hyperdynamics_options_t
• rmd_time_input : eonc::hyperdynamics_options_t
• Rmdsteps() : eonc::BondBoost
• rmdSteps() : eonc::BondBoost
• rn_ : forcefields::Tip4p::Water
• rNbCut : EMT
• rng_ : eonc::pathintegral::RingPolymer
• ro1_2_ro2_2() : forcefields::Ccl
• ro1_ro2() : forcefields::Ccl
• ro1_ro2_ro_2() : forcefields::Ccl
• ro1_ro2_theta() : forcefields::Ccl
• ro1_ro2_theta_2() : forcefields::Ccl
• ro_ : forcefields::SpceCcl::Water, forcefields::Tip4p::Water
• ro_2() : forcefields::Ccl
• ro_2_theta() : forcefields::Ccl
• ro_2_theta_2() : forcefields::Ccl
• ro_3() : forcefields::Ccl
• ro_3_theta() : forcefields::Ccl
• ro_4() : forcefields::Ccl
• ro_ro1_ro2() : forcefields::Ccl
• ro_ro1_ro2_theta() : forcefields::Ccl
• ro_theta() : forcefields::Ccl
• ro_theta_2() : forcefields::Ccl
• roh_ : forcefields::SpceCcl
• rot_opt_method : eonc::gpr_dimer_options_t
• rotate() : eonc::Dimer
• rotation : eonc::IRACompare::MatchResult
• rotation_angle : eonc::dimer_options_t, eonc::gpr_dimer_options_t
• rotation_backend : eonc::dimer_options_t
• rotationalPlane : eonc::AtomicGPDimer, eonc::Dimer
• rotationDidConverge : eonc::ImprovedDimer
• rotations : eonc::DimerRotationResult
• rotations_max : eonc::dimer_options_t
• rotations_min : eonc::dimer_options_t
• rotNorm : eonc::OHTSTJob::PlaneAverages
• rotRaw : eonc::OHTSTJob::PlaneAverages
• rPrev : eonc::ImprovedDimer
• run() : eonc::ARTnSaddleSearch, eonc::BasinHoppingJob, eonc::BasinHoppingSaddleSearch, eonc::BiasedGradientSquaredDescent, eonc::ConjugateGradients, eonc::Dynamics, eonc::DynamicsJob, eonc::DynamicsSaddleSearch, eonc::FiniteDifferenceJob, eonc::FIRE, eonc::GlobalOptimization, eonc::GlobalOptimizationJob, eonc::GPSurrogateJob, eonc::HessianJob, eonc::InstantonJob, eonc::Job, eonc::LBFGS, eonc::MinimizationJob, eonc::MinModeSaddleSearch, eonc::MonteCarlo, eonc::MonteCarloJob, eonc::neb::OCINEBController, eonc::NudgedElasticBandJob, eonc::OHTSTJob, eonc::Optimizer, eonc::ParallelReplicaJob, eonc::PointJob, eonc::PrefactorJob, eonc::ProcessSearchJob, eonc::Quickmin, eonc::ReplicaDynamicsJob, eonc::ReplicaExchangeJob, eonc::SaddleSearchJob, eonc::SaddleSearchMethod, eonc::SteepestDescent, eonc::StructureComparisonJob, eonc::TestJob, eonc::XtsciOptimizer, XtsciOptimizer
• runAMS() : AMS
• runDimer() : eonc::neb::OCINEBController
• runFromMatter() : eonc::GPSurrogateJob, eonc::ParallelReplicaJob, eonc::ProcessSearchJob, eonc::ReplicaDynamicsJob, eonc::ReplicaExchangeJob, eonc::SaddleSearchJob
• runPathIntegral() : eonc::Dynamics
• runPrepared() : eonc::ProcessSearchJob, eonc::SaddleSearchJob
• runRetainFrames() : eonc::MinModeSaddleSearch
• Runtime : eonc::ARTnResource, eonc::IRAResource, eonc::MetatomicLoader, eonc::PluginLoader, eonc::Runtime
• runtime_ : eonc::Job
• runWorkerLoop() : LAMMPSPot