Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

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- s -

• s : eonc::ImprovedDimer, ImprovedDimer
• s_init : eonc::Parameters::oh_tst_options_t, Parameters::oh_tst_options_t
• saddle : BasinHoppingSaddleSearch, BiasedGradientSquaredDescent, DynamicsSaddleSearch, eonc::BasinHoppingSaddleSearch, eonc::BiasedGradientSquaredDescent, eonc::DynamicsSaddleSearch, eonc::ProcessSearchJob, eonc::ReplicaDynamicsJob, eonc::SaddleSearchJob, ProcessSearchJob, ReplicaDynamicsJob, SaddleSearchJob
• saddle_search_options : eonc::Parameters, Parameters
• saddleSearch : eonc::ProcessSearchJob, eonc::SaddleSearchJob, ProcessSearchJob, SaddleSearchJob
• SaddleSearchJob() : eonc::SaddleSearchJob, SaddleSearchJob
• SaddleSearchMethod() : eonc::SaddleSearchMethod, SaddleSearchMethod
• sample_steps : eonc::Parameters::oh_tst_options_t, Parameters::oh_tst_options_t
• samplePlane() : eonc::OHTSTJob, OHTSTJob
• sampling_time : eonc::Parameters::replica_exchange_options_t, Parameters::replica_exchange_options_t
• sampling_time_input : eonc::Parameters::replica_exchange_options_t, Parameters::replica_exchange_options_t
• saveData() : eonc::GPSurrogateJob, eonc::NudgedElasticBandJob, eonc::ProcessSearchJob, eonc::ReplicaDynamicsJob, eonc::ReplicaExchangeJob, eonc::SaddleSearchJob, GPSurrogateJob, NudgedElasticBandJob, ProcessSearchJob, ReplicaDynamicsJob, ReplicaExchangeJob, SaddleSearchJob
• scalars : eonc::io::ConFrameMetadata
• scale_ratio : eonc::Parameters::saddle_search_options_t::confine_positive_t, Parameters::saddle_search_options_t::confine_positive_t
• scan_planes : eonc::Parameters::oh_tst_options_t, Parameters::oh_tst_options_t
• scatter_atoms : eonc::LammpsLoader
• scatter_atoms_fn : eonc::LammpsLoader
• scf_maxiter : eonc::Parameters::ase_nwchem_options_t, Parameters::ase_nwchem_options_t
• scf_thresh : eonc::Parameters::ase_nwchem_options_t, Parameters::ase_nwchem_options_t
• scf_type : eonc::Parameters::rgpot_options_t, Parameters::rgpot_options_t, RGPotEngineOptions
• scheduleStep() : BondBoost, eonc::BondBoost
• scm_pythondir : eonc::Parameters::ams_options_t::env_t, Parameters::ams_options_t::env_t
• scm_tmpdir : eonc::Parameters::ams_options_t::env_t, Parameters::ams_options_t::env_t
• scmlicense : eonc::Parameters::ams_options_t::env_t, Parameters::ams_options_t::env_t
• Scoped() : eonc::log::Scoped
• scratch_dir : eonc::Parameters::rgpot_options_t, Parameters::rgpot_options_t, RGPotEngineOptions
• sd : eonc::Parameters::optimizer_options_t, Parameters::optimizer_options_t
• search_paths() : eonc::PluginLoader
• send_exact() : SocketNWChemPot
• send_header() : SocketNWChemPot
• seq : emt_parameters
• serve_options : eonc::Parameters, Parameters
• server_address : SocketNWChemPot
• set_param_ : eonc::ARTnResource
• set_param_fn : eonc::ARTnResource
• setAtomicNr() : eonc::Matter, Matter
• setAtomicNrs() : eonc::Matter, Matter
• SetAtomicNumbers() : Atoms
• setAtomIndex() : eonc::Matter, Matter
• SetAtoms() : AsapPotential, EMT, SuperCell
• SetBasis() : SuperCell
• setBiasForces() : eonc::Matter, Matter
• setBiasPotential() : eonc::Matter, Matter
• SetCalculator() : Atoms
• SetCartesianPositions() : Atoms
• setCell() : eonc::Matter, Matter
• setCIEnabled() : eonc::NudgedElasticBand, NudgedElasticBand
• setComputedPotential() : eonc::Matter, Matter
• SetContinuumElement() : EMT
• setCutoff() : forcefields::PotentialBase
• setFixed() : eonc::Matter, Matter
• setFixedMask() : eonc::Matter, Matter
• setForces() : eonc::Matter, Matter
• SetGhostPotential() : GhostAtoms
• setHeaderCon() : eonc::Matter, Matter
• setHeaderConLine() : eonc::Matter, Matter
• setMass() : eonc::Matter, Matter
• setMasses() : eonc::Matter, Matter
• SetNumberOfAtoms() : Atoms
• SetNumberOfGhosts() : GhostAtoms
• SetNumberOfImages() : Atoms
• setPbcConvention() : eonc::Matter, Matter
• SetPeriodic() : SuperCell
• setPeriodic() : eonc::Matter, Matter
• setPeriodicity() : forcefields::PotentialBase
• setPlatinum() : forcefields::ZhuPhilpott< P >
• setPosition() : eonc::Matter, Matter
• setPositions() : BGSDObjectiveFunction, CollectiveIDPPObjectiveFunction, eonc::CollectiveIDPPObjectiveFunction, eonc::IDPPObjectiveFunction, eonc::Matter, eonc::NEBObjectiveFunction, eonc::ObjectiveFunction, eonc::ZBLRepulsiveIDPPObjective, IDPPObjectiveFunction, Matter, MinModeObjectiveFunction, NEBObjectiveFunction, ObjectiveFunction, ZBLRepulsiveIDPPObjective
• setPositionsFree() : eonc::Matter, Matter
• setPositionsFreeV() : eonc::Matter, Matter
• setPositionsV() : eonc::Matter, Matter
• setPotential() : eonc::Matter, Matter
• setReferenceMode() : eonc::ImprovedDimer, ImprovedDimer
• SetSubtractE0() : EMT
• setSwitchingWidth() : forcefields::PotentialBase
• setTemperature() : Dynamics, eonc::Dynamics
• setThermalVelocity() : Dynamics, eonc::Dynamics
• SetUnitCell() : Atoms
• SetUnwrappedPositions() : Atoms
• setup_artn_ : eonc::ARTnResource
• setup_artn_fn : eonc::ARTnResource
• setup_server() : SocketNWChemPot
• setVelocities() : eonc::Matter, Matter
• setVelocity() : eonc::Matter, Matter
• shell0 : EMTDefaultParameterProvider
• shell1 : EMTDefaultParameterProvider
• shift() : eonc::VesinNeighbors
• shouldResetOptimizer : eonc::neb::OCINEBController::MMFResult
• shouldTrigger() : eonc::neb::OCINEBController
• sidpp_alpha : eonc::Parameters::neb_options_t::path_initialization_t, Parameters::neb_options_t::path_initialization_t
• sidpp_frontier_tol : eonc::Parameters::neb_options_t::path_initialization_t, Parameters::neb_options_t::path_initialization_t
• sidpp_ideal_ksp : eonc::Parameters::neb_options_t::path_initialization_t, Parameters::neb_options_t::path_initialization_t
• sidpp_reparam : eonc::Parameters::neb_options_t::path_initialization_t, Parameters::neb_options_t::path_initialization_t
• sigma() : forcefields::PotentialBase
• sigma1 : EMT
• sigma2 : EMT, eonc::Parameters::gpr_dimer_options_t::gpr_params_t, Parameters::gpr_dimer_options_t::gpr_params_t
• sigma2isvalid : EMT
• sigma_ : forcefields::SpceCcl
• sigma_batch() : EMT
• SIGMA_PT : forcefields::PotentialBase
• sigmaH_ : forcefields::zhu_philpott_parameters::Iceland, forcefields::zhu_philpott_parameters::Standard
• sigmaHPt_ : forcefields::zhu_philpott_parameters::Iceland, forcefields::zhu_philpott_parameters::Standard
• sigmaO_ : forcefields::zhu_philpott_parameters::Iceland, forcefields::zhu_philpott_parameters::Standard
• sigmaOPt_ : forcefields::zhu_philpott_parameters::Iceland, forcefields::zhu_philpott_parameters::Standard
• significant_structure : eonc::Parameters::basin_hopping_options_t, Parameters::basin_hopping_options_t
• simpleinput : eonc::Parameters::ase_orca_options_t, Parameters::ase_orca_options_t
• single_atom_displace : eonc::Parameters::basin_hopping_options_t, Parameters::basin_hopping_options_t
• single_step() : ConjugateGradients, eonc::ConjugateGradients
• size : CellList, eonc::VesinNeighbors
• skin : eonc::VesinNeighbors::Options
• smallSys() : AMS
• smithKongEpsilon() : forcefields::PotentialBase
• smithKongSigma() : forcefields::PotentialBase
• so3_probe_scatter : RgpotMtaConfig
• socket_nwchem_options : eonc::Parameters, Parameters
• SocketNWChemPot() : SocketNWChemPot
• sorted : eonc::VesinNeighbors::Options
• spawnVASP() : VASP
• SpceCcl() : forcefields::SpceCcl, SpceCcl
• spreadForce() : forcefields::PotentialBase
• spreadWeightedForce() : forcefields::PotentialBase
• spring : eonc::Parameters::neb_options_t, Parameters::neb_options_t
• springConstants : eonc::neb::WeightedSpring
• springResult : eonc::neb::ImageForceData
• stabilityCount() : eonc::neb::OCINEBController
• state_check_interval : eonc::Parameters::parallel_replica_options_t, eonc::Parameters::saddle_search_options_t::dynamics_t, Parameters::parallel_replica_options_t, Parameters::saddle_search_options_t::dynamics_t
• state_check_interval_input : eonc::Parameters::parallel_replica_options_t, eonc::Parameters::saddle_search_options_t::dynamics_t, Parameters::parallel_replica_options_t, Parameters::saddle_search_options_t::dynamics_t
• statsAngle : eonc::LowestEigenmode, LowestEigenmode
• statsCurvature : eonc::LowestEigenmode, LowestEigenmode
• statsRotations : eonc::LowestEigenmode, LowestEigenmode
• statsTorque : eonc::LowestEigenmode, LowestEigenmode
• Status : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• status : ARTnSaddleSearch, BasinHoppingSaddleSearch, BiasedGradientSquaredDescent, DynamicsSaddleSearch, eonc::ARTnSaddleSearch, eonc::BasinHoppingSaddleSearch, eonc::BiasedGradientSquaredDescent, eonc::DynamicsSaddleSearch, eonc::MinimizationJob, eonc::MinModeSaddleSearch, eonc::NEBObjectiveFunction, eonc::NudgedElasticBand, MinimizationJob, MinModeSaddleSearch, NEBObjectiveFunction, NudgedElasticBand
• STATUS_BAD_ARTN_ERROR : ARTnSaddleSearch, eonc::ARTnSaddleSearch
• STATUS_BAD_HIGH_BARRIER : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_HIGH_ENERGY : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_MAX_CONCAVE_ITERATIONS : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_MAX_ITERATIONS : ARTnSaddleSearch, eonc::ARTnSaddleSearch, eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_MD_TRAJECTORY_TOO_SHORT : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_MINIMA : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_NO_BARRIER : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_NO_CONVEX : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_NO_NEGATIVE_MODE_AT_SADDLE : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_NOT_CONNECTED : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_BAD_PREFACTOR : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_DIMER_LOST_MODE : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_DIMER_RESTORED_BEST : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_FAILED_PREFACTOR : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_GOOD : ARTnSaddleSearch, eonc::ARTnSaddleSearch, eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_INIT : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_NEGATIVE_BARRIER : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_NONLOCAL_ABORT : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_NONNEGATIVE_ABORT : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_OPTIMIZER_ERROR : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_POTENTIAL_FAILED : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• STATUS_ZEROMODE_ABORT : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• statusMessage() : eonc::MinModeSaddleSearch, MinModeSaddleSearch
• steepest_descent : eonc::Parameters::optimizer_options_t::quickmin_t, Parameters::optimizer_options_t::quickmin_t
• SteepestDescent() : eonc::SteepestDescent, SteepestDescent
• step() : ConjugateGradients, eonc::ConjugateGradients, eonc::FIRE, eonc::LBFGS, eonc::Optimizer, eonc::Quickmin, eonc::SteepestDescent, FIRE, LBFGS, Optimizer, Quickmin, SteepestDescent
• step_size : eonc::Parameters::monte_carlo_options_t, Parameters::monte_carlo_options_t
• steps : DynamicsConfig, eonc::DynamicsConfig, eonc::Parameters::basin_hopping_options_t, eonc::Parameters::dynamics_options_t, eonc::Parameters::global_optimization_options_t, eonc::Parameters::monte_carlo_options_t, Parameters::basin_hopping_options_t, Parameters::dynamics_options_t, Parameters::global_optimization_options_t, Parameters::monte_carlo_options_t
• stop_energy : eonc::Parameters::basin_hopping_options_t, Parameters::basin_hopping_options_t
• stopWorker() : LAMMPSPot
• stress : EMT
• stresses : EMT
• strings : eonc::io::ConFrameMetadata
• structComp : eonc::Matter, Matter
• STRUCTURE_COMPARISON_BRUTE_NEIGHBORS : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_CHECK_ROTATION : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_COVALENT_SCALE : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_DISTANCE_DIFFERENCE : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_ENERGY_DIFFERENCE : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_INDISTINGUISHABLE_ATOMS : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_NEIGHBOR_CUTOFF : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• structure_comparison_options : eonc::Parameters, Parameters
• STRUCTURE_COMPARISON_REMOVE_TRANSLATION : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• STRUCTURE_COMPARISON_USE_COVALENT : eonc::params_ssot::GeneratedDefaults
• StructureComparisonJob() : eonc::StructureComparisonJob, StructureComparisonJob
• sub_job : eonc::Parameters::gp_surrogate_options_t, Parameters::gp_surrogate_options_t
• subtractE0 : EMT
• SuperCell() : SuperCell
• superCell : Atoms, CellList
• superCellHeights : CellList
• SuperCellObj : EffectiveMediumTheory
• supportsBatchEvaluation() : eonc::Potential, MetatomicPotential, Potential, RgpotAdapter< RPot >
• SurrogatePotential() : eonc::SurrogatePotential, SurrogatePotential
• swap_count : BasinHoppingJob, eonc::BasinHoppingJob
• swap_probability : eonc::Parameters::basin_hopping_options_t, Parameters::basin_hopping_options_t
• switching() : forcefields::PotentialBase
• switchingWidth_ : forcefields::PotentialBase
• switchjob() : AMS
• symmetry_products : eonc::Parameters::oh_tst_options_t, Parameters::oh_tst_options_t
• symmetry_threshold : eonc::Parameters::ira_options_t, Parameters::ira_options_t
• symmetryReflect() : eonc::OHTSTJob, OHTSTJob